Při této metodě transplantace vlasů se vlasové štěpy odebírají po jednom, přímo z dárcovské oblasti pacienta. Ke sběru se používají kruhové, duté jehly. Po sběru lékař zhodnotí kvalitu štěpů a počet folikulů, které nesou a určí, do jakých míst různé druhy štěpů implantovat.
Při klasické FUE se u zákroku pro tvorbu kanálků používají jehly z nerezové oceli o průměru 1,09 mm. Alternativou jsou jehly se safírovou špičkou (Sapphire FUE), která je ostřejší a netupí se. Díky tomu se rány rychleji hojí a šance na uchycení štěpů je tak vyšší.
Metoda FUE se používá především u mužů, kteří trpí plešatostí na temeni hlavy a u této metody se aplikuje až 5 500 štěpů. Maximální počet štěpů, ale vždy rozhoduje klinika podle stavu pacienta. Záleží hlavně na rozsahu vypadlých vlasů a síle zdravé, dárcovské oblasti.